拍摄团队跟着李兰洁一行，首先来到了日本。在京都的古老町屋，晓芸与一位制作传统酱油的工匠会面。工匠家的酱油酿造坊弥漫着浓郁的酱香，巨大的木桶里，酱油在微生物的作用下慢慢发酵。小雨好奇地观察着工匠的每一个步骤，发现日本酱油发酵过程中对温度和湿度的控制极为精细，这与中国传统酱油酿造虽有相似之处，却又有着独特的日式匠心。
老张则被日本的和纸艺术吸引。他想到，能否将和纸的质感与泡菜坛的制作相结合呢？在当地艺术家的帮助下，他尝试将和纸的纤维融入陶土中，烧制出的泡菜坛表面有着独特的纹理，仿佛带着岁月的痕迹。当把日本的渍物放入这些特别的泡菜坛中时，传统与创新的碰撞，让这小小的一坛渍物有了别样的韵味。
接着，他们来到法国的葡萄酒庄。在葡萄园里，酿酒师向晓芸展示了葡萄从采摘到发酵成美酒的全过程。这里的微生物发酵是一场与时间的浪漫对话，每一瓶葡萄酒都蕴含着阳光、土壤和微生物的独特气息。小雨通过显微镜观察葡萄酒发酵过程中的酵母菌，发现它们与之前研究的发酵微生物有着千丝万缕的联系。
老张被酒庄的建筑风格和酒标设计所启发，他在泡菜坛上绘制出精美的葡萄藤蔓和酒庄城堡图案，将法国的浪漫风情融入到泡菜坛中。当这些泡菜坛装满中国的泡菜，摆在法国的餐桌上时，东西方饮食文化在这一刻奇妙交融。
纪录片拍摄接近尾声时，李兰洁收到了一个来自北极科考站的紧急求助。科考站的食物储备出现问题，低温环境下，普通的食物保存方式失效，而他们急需一些能在极端环境下发酵保存且富含营养的食物。晓芸和小雨立刻投入研究，结合之前在各地收集的微生物样本，筛选出一种能在低温下快速发酵且产生多种营养物质的微生物菌株。
老张则根据北极的环境特点，设计出一种特殊的泡菜坛。这种泡菜坛采用特殊的保温材料，能在极寒环境下保持内部温度稳定，确保微生物正常发酵。他们带着这些成果火速赶往北极科考站。
在北极的冰天雪地中，李兰洁团队与科考队员们一起，将菌株加入到当地的食材中进行发酵实验。经过几天的等待，成功发酵出了美味又营养的食物。科考队员们对这些食物赞不绝口，李兰洁团队也为能在这片遥远的极地为人们解决实际问题而感到无比自豪。
随着纪录片的播出，全球掀起了一股微生物文化热潮。世界各地的人们开始重新审视身边的发酵美食，不同文化背景的人通过微生物这个微小的纽带，展开了一场又一场跨越国界的交流与合作，而李兰洁团队也在这条充满挑战与惊喜的微生物文化传承之路上，继续坚定地前行着 。
